Hồ Sơ Tuyệt Mật (Phần 9) là một bộ phim ly kỳ và đầy kịch tính, nơi sự an toàn của những nhân vật chính luôn bị đe dọa. Khi Mulder biến mất một lần nữa, Scully và con trai cô, William, phải đối mặt với nguy hiểm không ngừng. Đặc vụ Doggett, người đang cố gắng điều tra Phó Giám đốc Kersh, cảm thấy thất vọng khi không thể tìm thấy Mulder. Tuy nhiên, với sự thuyết phục của Scully và Skinner, anh cuối cùng từ bỏ vụ án của mình. Scully sau đó tham gia giúp đỡ Đặc vụ Doggett và Đặc vụ Reyes trong một số vụ án, nhưng cô không thể tránh khỏi cảm giác lo lắng cho sự an toàn của William. Khi biết một giáo phái tôn giáo muốn con trai mình chết, cô tìm đến Lone Gunmen, những người bạn cũ của Mulder, để nhờ giúp đỡ. Dù họ có gắng bảo vệ, William vẫn bị bắt cóc, và Scully phải đưa ra quyết định khó khăn để đảm bảo sự an toàn cho con mình. Trong lúc tuyệt vọng, tin tức về việc Mulder được tìm thấy mang lại một tia hy vọng, dù anh đang bị giam giữ vì tội giết một người đàn ông không thể chết. Với những tình tiết ly kỳ và đầy bất ngờ, Hồ Sơ Tuyệt Mật (Phần 9) sẽ đưa khán giả vào một thế giới đầy bí ẩn và nguy hiểm, nơi lòng trung thành, tình mẫu tử và sự thật luôn bị đe dọa. Bộ phim sẽ giữ khán giả ở cạnh ghế với những diễn biến không ngừng và kết thúc đầy bất ngờ.
